Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cep55Q8BT07 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep55Q8BT07 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep55Q8BT07 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep55Q8BT07 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cep55Q8BT07 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms