Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdhaf3Q8BQU3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdhaf3Q8BQU3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdhaf3Q8BQU3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdhaf3Q8BQU3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdhaf3Q8BQU3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdhaf3Q8BQU3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdhaf3Q8BQU3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sdhaf3Q8BQU3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sdhaf3Q8BQU3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sdhaf3Q8BQU3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdhaf3Q8BQU3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdhaf3Q8BQU3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms