Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grik4Q8BMF5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik4Q8BMF5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms