Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AW551984Q8BGF0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AW551984Q8BGF0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AW551984Q8BGF0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW551984Q8BGF0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms