Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmtc4Q8BG19 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc4Q8BG19 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms