Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnma8aQ80VM8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnma8aQ80VM8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnma8aQ80VM8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma8aQ80VM8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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