Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pja2Q80U04 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pja2Q80U04 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja2Q80U04 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja2Q80U04 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms