Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sgo2Q7TSY8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sgo2Q7TSY8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgo2Q7TSY8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sgo2Q7TSY8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.9 ms