Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQC5

Aptx, Aprataxin, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AptxQ7TQC5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AptxQ7TQC5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AptxQ7TQC5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AptxQ7TQC5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AptxQ7TQC5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AptxQ7TQC5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AptxQ7TQC5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AptxQ7TQC5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AptxQ7TQC5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms