Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp1r3cQ7TMB3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp1r3cQ7TMB3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp1r3cQ7TMB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp1r3cQ7TMB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp1r3cQ7TMB3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp1r3cQ7TMB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp1r3cQ7TMB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp1r3cQ7TMB3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp1r3cQ7TMB3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ppp1r3cQ7TMB3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppp1r3cQ7TMB3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r3cQ7TMB3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms