Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl35Q6ZWV7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpl35Q6ZWV7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl35Q6ZWV7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms