Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp34Q6ZQ93 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp34Q6ZQ93 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp34Q6ZQ93 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp34Q6ZQ93 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp34Q6ZQ93 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms