Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxcl3Q6W5C0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl3Q6W5C0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl3Q6W5C0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms