Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9c1Q6UJY2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slc9c1Q6UJY2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9c1Q6UJY2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc9c1Q6UJY2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms