Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gja6Q6S5G4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja6Q6S5G4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gja6Q6S5G4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms