Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GmipQ6PGG2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GmipQ6PGG2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GmipQ6PGG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GmipQ6PGG2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms