Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrt3Q6PE13 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrt3Q6PE13 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrt3Q6PE13 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prrt3Q6PE13 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrt3Q6PE13 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms