Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2d40Q6P8N9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp2d40Q6P8N9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms