Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcf1Q6P542 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcf1Q6P542 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcf1Q6P542 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcf1Q6P542 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms