Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Podnl1Q6P3Y9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Podnl1Q6P3Y9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Podnl1Q6P3Y9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Podnl1Q6P3Y9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms