Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg16l2Q6KAU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atg16l2Q6KAU8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg16l2Q6KAU8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms