Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd2Q6DVA0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lemd2Q6DVA0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd2Q6DVA0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lemd2Q6DVA0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lemd2Q6DVA0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms