Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pds5aQ6A026 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pds5aQ6A026 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pds5aQ6A026 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pds5aQ6A026 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pds5aQ6A026 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pds5aQ6A026 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pds5aQ6A026 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms