Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fnip1Q68FD7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fnip1Q68FD7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fnip1Q68FD7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fnip1Q68FD7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fnip1Q68FD7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fnip1Q68FD7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fnip1Q68FD7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fnip1Q68FD7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fnip1Q68FD7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fnip1Q68FD7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fnip1Q68FD7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms