Protein–RNA interactions for Protein: Q66JS6

Eif3j2, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j2Q66JS6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Eif3j2Q66JS6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif3j2Q66JS6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3j2Q66JS6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3j2Q66JS6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms