Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hist2h2beQ64524 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hist2h2beQ64524 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hist2h2beQ64524 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms