Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Top2bQ64511 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Top2bQ64511 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Top2bQ64511 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Top2bQ64511 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Top2bQ64511 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms