Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr2e1Q64104 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr2e1Q64104 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr2e1Q64104 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr2e1Q64104 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nr2e1Q64104 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nr2e1Q64104 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr2e1Q64104 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms