Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col4a5Q63ZW6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Col4a5Q63ZW6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col4a5Q63ZW6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col4a5Q63ZW6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms