Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tff3Q62395 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff3Q62395 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms