Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RhocQ62159 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RhocQ62159 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RhocQ62159 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RhocQ62159 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RhocQ62159 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RhocQ62159 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhocQ62159 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhocQ62159 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RhocQ62159 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhocQ62159 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RhocQ62159 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhocQ62159 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RhocQ62159 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms