Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna1eQ61290 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1eQ61290 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1eQ61290 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms