Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mre11Q61216 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mre11Q61216 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mre11Q61216 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mre11Q61216 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms