Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp4Q61107 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gbp4Q61107 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbp4Q61107 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp4Q61107 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp4Q61107 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms