Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Traf3Q60803 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf3Q60803 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf3Q60803 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms