Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a1Q60737 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a1Q60737 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a1Q60737 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms