Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc27a1Q60714 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc27a1Q60714 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc27a1Q60714 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc27a1Q60714 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc27a1Q60714 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms