Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb6Q60692 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb6Q60692 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms