Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChukQ60680 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChukQ60680 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChukQ60680 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChukQ60680 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ChukQ60680 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChukQ60680 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChukQ60680 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChukQ60680 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms