Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ItgaeQ60677 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ItgaeQ60677 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ItgaeQ60677 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ItgaeQ60677 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ItgaeQ60677 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ItgaeQ60677 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ItgaeQ60677 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ItgaeQ60677 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ItgaeQ60677 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ItgaeQ60677 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ItgaeQ60677 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ItgaeQ60677 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ItgaeQ60677 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ItgaeQ60677 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms