Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HnrnpdQ60668 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpdQ60668 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpdQ60668 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms