Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr1h2Q60644 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr1h2Q60644 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr1h2Q60644 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr1h2Q60644 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr1h2Q60644 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1h2Q60644 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1h2Q60644 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1h2Q60644 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1h2Q60644 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1h2Q60644 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h2Q60644 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h2Q60644 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms