Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms