Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mdc1Q5PSV9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mdc1Q5PSV9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Mdc1Q5PSV9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Mdc1Q5PSV9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Mdc1Q5PSV9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Mdc1Q5PSV9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms