Protein–RNA interactions for Protein: Q5IBH6

Spdye4a, Speedy protein E4A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4aQ5IBH6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spdye4aQ5IBH6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spdye4aQ5IBH6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spdye4aQ5IBH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spdye4aQ5IBH6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spdye4aQ5IBH6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spdye4aQ5IBH6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spdye4aQ5IBH6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spdye4aQ5IBH6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spdye4aQ5IBH6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spdye4aQ5IBH6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spdye4aQ5IBH6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spdye4aQ5IBH6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spdye4aQ5IBH6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spdye4aQ5IBH6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms