Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp28Q5I043 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp28Q5I043 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp28Q5I043 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp28Q5I043 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms