Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms