Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp22Q5DU02 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp22Q5DU02 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp22Q5DU02 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp22Q5DU02 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 942.7 ms