Protein–RNA interactions for Protein: Q58Y74

Trcg1, Taste receptor cell protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trcg1Q58Y74 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trcg1Q58Y74 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trcg1Q58Y74 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trcg1Q58Y74 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trcg1Q58Y74 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms