Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccnl1Q52KE7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccnl1Q52KE7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccnl1Q52KE7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccnl1Q52KE7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccnl1Q52KE7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms