Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Arap1Q4LDD4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Arap1Q4LDD4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Arap1Q4LDD4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Arap1Q4LDD4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Arap1Q4LDD4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms